自1999年神舟一號飛船發射以來，中國歷次載人航天發射大都集中秋冬兩季，而神舟九號飛船預計6月中旬升空，選擇盛夏6月發射尚是首次，將面臨雷電、高溫等天氣考驗。

　　酒泉衛星發射中心氣象室主任李興東介紹，在可能干擾載人航天發射的雷電、大風、降水、電場強度等幾大氣象條件中，雷電影響最大。

　　從1981年到2011年間30年的氣象資料顯示，酒泉衛星發射場地區在秋冬季基本沒有雷電，夏季雷電發生頻率約每月2.6次。李興東解釋說，這種極端小概率天氣雖然發生頻率不高，但可能造成災難性后果。為此，近30名預報員正在全力以赴對神九發射窗口天氣情況做出準確預報。

　　氣溫也是航天發射不可忽視的因素，火箭推進劑在溫度過高時可能汽化，溫度過低則可能凝固，甚至導致部分元器件失靈。

　　航天科技集團長征二號F火箭總體主任設計師張旭輝介紹，高溫對逃逸(塔)固體發動機影響最大，其目前的額定溫度是20℃，正負10℃范圍內溫度都能夠適應。

　　發射前的關鍵一步是推進劑加注，溫度過高可能汽化。火箭系統有關專家表示，儲存推進劑的庫房在加注前將進行降溫，以降低燃料的初始溫度。